（1）补植
凡死区及缺株应及时按无性系号或优树号补植。
（2）剪砧
无性系嫁接种子园要对植株逐年剪砧。
（3）土壤管理
包括松土、除草、间作、施肥、灌溉等。
（4）树体管理
修枝整形、控制树高。
（5）花粉管理
一般在优树搜集区或种子园内采集优良无性系的花粉进行人工辅助授粉。若为虫媒花树种，应注意昆虫的放养。
（6）疏伐和保护
根据子代测定资料及无性系表型鉴定材料，适当进行疏伐。注意病虫害防治、护林防火、防止人畜破坏等。
种子园建立后要建立技术档案，主要内容有：规划设计说明书及种子园区划图、种子园无性系（或家系）配置图、种子园优树登记表、种子园建情况登记表、种子园经营活动登记表等。
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